Bereits vor etwa 1.000 Jahren hatten die Anasazi zur Blütezeit ihrer Kultur Wohnstätten in den Felswänden des Canyon, die sie aber - ähnlich wie die Siedlungen von Mesa Verde - um 1300 wieder verließen.

Um 1700 ließen sich Navajo in dem sehr fruchtbaren Tal nieder. Sie wurden mehrmals vertrieben, kehrten aber immer wieder zurück und heute ist der Park ein Teil der Navajo Indian Reservation. Berühmt ist der Spider Rock, eine 244 m hohe Felsnadel, an der, so die Legende, die Spinnenfrau den Navajos die Kunst des Webens lehrte.

Das National Monument unterteilt sich in 2 Bereiche:
Canyon de Chelly mit dem Spider Rock und der White House Ruin, einer kleinen Siedlung an Fuße einer Felswand bzw. einem 2-ten Teil wenige Meter darüber in einer Felsnische gelegen.

Canyon del Muerto mit Ledge Ruin, Antelope House Ruin und Mummy Cave Ruin, der nördlichere und weniger attraktivere Teil des Monuments.